南農合作發(fā)布蘭州百合基因組

本報訊 10 月 24 日，我校園藝學院滕年軍教授團隊、薛佳宇副教授團隊， 華中農業(yè)大學園藝林學學院寧國貴教授團隊與福建農林大學明瑞光教授團隊等國內 10 多家科研團隊聯合公布了百合高質量染色體級別基因組， 成為世界上首個正式報道的最大植物基因組。 相關文章“The evolutionary tale oflilies: Giant genomes derived from transposon insertions andpolyploidization”發(fā)表在《The Innovation》期刊。

基因組存儲了一個物種的完整遺傳信息， 是理解其生物學特性和進化歷程的關鍵。 自然界中，不同生物的基因組揭示了生命之樹上基因組大小的巨大差異， 其中一些植物擁有超大的基因組。 然而，這些超大基因組的起源和形成機制卻不盡相同。 百合是單子葉百合目百合科多年生植物，因其極高的觀賞、食用與藥用價值而備受關注。本研究利用 Nanopore、Illumina 和 Hi-C 測序技術，以及優(yōu)化的組裝方法， 獲得了 36.68 Gb 的蘭州百合超大型基因組，并解析了其形成機制和特征， 也揭示了鱗莖營養(yǎng)物質積累的遺傳基礎。這一成果標志著百合的分子研究進入新時代，也是植物基因組學的重要突破性研究進展之一。

我校為該論文的第一署名單位和通訊單位，我校鐘山青年研究員徐素娟博士、已畢業(yè)碩士張心祺、吳玉峰教授，華中農業(yè)大學博士生陳潤洲以及上海市農科院楊柳燕研究員為論文的共同第一作者；滕年軍、薛佳宇、寧國貴、明瑞光為論文共同通訊作者；北京林業(yè)大學、海南大學等單位 20 多位合作者參與本研究。 本研究得到了國家重點研發(fā)計劃、江蘇省種業(yè)振興揭榜掛帥項目等資助和我校生物信息學中心高性能計算平臺的支持。

（園藝學院）